工程硕士的专业有：机械工程、光学工程、仪器仪表工程、项目管理、材料工程、治金工程、动力工程、电气工程、电子与通信工程、集成电路工程、控制工程、计算机技术、建筑与土木工程、水利工程、测绘工程、化学工程、地质工程、矿业工程、石油与天然气工程、纺织工程、轻工技术与工程、交通运输工程、船舶与海洋工程、安全工程、兵器工程、核能与核技术工程、农业工程、林业工程、环境工程、生物医学工程、航天工程、车辆工程、制药工程、工业工程、工业设计工程、生物工程、物流工程等。
材料补充：
1、工程硕士简介：工程硕士（Master of Engineering，ME）属于专业硕士学位的一种，是工程类专业学位，分为全日制工程硕士和非全日制工程硕士。工程硕士专业学位在招收对象、培养方式和知识结构与能力等方面，与工学硕士学位有不同的特点。工程硕士专业学位侧重于工程应用，主要是为工矿企业和工程建设部门，特别是国有大中型企业培养应用型、复合型高层次工程技术和工程管理人才。
2、工程硕士与工学硕士的不同：工程硕士专业学位是与工程领域任职资格相联系的专业性学位，它与工学硕士学位处于同一层次，但类型不同，各有侧重。工程硕士专业学位侧重于工程应用，主要是为工矿企业和工程建设部门，特别是国有大中型企业培养应用型、复合型高层次工程技术和工程管理人才。工程硕士专业学位在招收对象、培养方式和知识结构与能力等方面，与工学硕士学位有不同的特点。工程硕士分为全日制工程硕士和GCT工程硕士。
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